这个修道院与俄罗斯帝国最后一个罗曼诺夫王朝有着很深的渊源，留里克王朝的伊凡雷帝因为亲手杖杀了王储儿子，而后继无人，在列宾的著名画作里有介绍，之后另一个儿子的小舅子鲍里斯戈都诺夫当了沙皇，米哈伊尔的父亲费奥多尔·尼基季奇·罗曼诺夫，是伊凡四世的中央顾问。1600年和母亲一起遭到流放。这是鲍里斯·戈都诺夫当选沙皇的结果，排除异己。
在1613年米哈伊尔·费奥多罗维奇在1613年2月21日被国民议会推选为沙皇，米哈伊尔当时还是一个16岁的少年，此前名不见经传。（当选为沙皇以后，他还害怕的躲了起来，因为前几任沙皇都没有好结果。）如果按照家谱算起来，米哈伊尔也可以算是皇亲国戚，和留里克王朝有些渊源：他是伊凡四世的第一个妻子，也就是皇后阿纳斯塔西娅（科斯特罗马市中心有一座安娜斯塔西娅圣显女修道院）的侄孙。此外，罗曼诺夫家族在俄罗斯内忧外患交迫的“王朝混乱时期”也因为大义不屈的举动赢得俄罗斯人的爱戴，获得一定的声誉。当年戈东诺夫强行把米哈伊尔的父亲费奥多尔·尼基季奇·罗曼诺夫强行送进伊帕季耶夫修道院（这个修道院受到过戈都诺夫家族1000卢布的资助，并繁荣起来，修道院里有鲍里斯戈都诺夫父母亲的墓），当了教士，改名为神父菲拉列特；后来季米特里三世又把菲拉列特神父掠走，任命他做俄罗斯东正教大牧首；在波兰被米宁和波扎尔斯基起义军赶出莫斯科后，菲拉列特大牧首拒绝与波兰国王西格蒙德合作，在民族利益上不作丝毫让步，遭到波兰军队逮捕并被长期关押。有这样的大背景，米哈伊尔罗曼诺夫成为开朝代的罗曼诺夫第一任沙皇，虽治国无能，但承上启下，渡过了一个过渡时期，他的孙子彼得大帝则大展拳脚，沙俄迅速成为世界上领土最大的帝国。这个修道院对于罗曼诺夫王朝意义重大。
此修道院，前任和现任俄罗斯总统都来过，还有亲笔题字保存于此。　　圣三一伊帕季耶夫男修道院