位于蒙德古河边的圣克拉拉修道院（旧）Mosteiro de Santa Clara-a-Velha由于频繁遭受河水季节性泛滥之灾，修道院以不断加高地面及修建防洪墙的做法抵御每年冬季的洪水，但都不能摆脱困扰。1612~1616年间，修道院被迫在旁边的半山腰修建新的修道院，以取代不能维持日常使用的旧址。1677年，新圣克拉拉修道院(Mosteiro de Santa Clara-a-Nova)修建完毕，宗教团体全员迁移，圣伊莎贝尔皇后的棺椁也迁移至此，旧有的修道院被彻底废弃。由于二处修道院都冠名圣克拉拉修道院，因此在称呼上加入“新Nova”、“旧Velha”以示区别。
新圣克拉拉修道院位于旧圣克拉拉修道院旁边的半山腰，即蒙德古河(Mondego)西岸的小山坡上，在科英布拉老城都能看见它不俗的外观。修道院内摆放着圣伊莎贝尔皇后的棺椁，她于1625年被册封为圣徒，同时也成为这座城市的守护神。教堂内部金碧辉煌，建筑装饰可圈可点。
同时，由于这里地势高，是眺望老城的“观景台”及拍摄夜景的理想地点。新圣克拉拉修道院